Изучение и измерение причинных связей в анализе можно осуществить методом индукции и дедукции. Способ изучения причинных связей с помощью логической индукции заключается в том, что исследование ведется от частного к общему, от частных фактов к обобщениям, от причин к результатам. Дедукция — такой способ, когда исследование осуществляется от общих фактов к частным, от результатов к причинам. В АХД используется и тот и другой подход. Метод индукции применяется для комплексной оценки чувствительности всех показателей к изменению отдельных факторов. С помощью дедукции исследуется весь комплекс факторов, формирующих исследуемый результативный показатель.
Согласно диалектическому методу познания каждый процесс, каждое экономическое явление надо рассматривать как систему, как совокупность многих взаимосвязанных элементов, каждый из которых вносит свой вклад в ее развитие. Любое воздействие внутреннего или внешнего характера на один из элементов системы отражается и на других ее элементах. Из этого следует необходимость системного подхода к изучению объектов анализа, что является еще одним из направлений методологии исследования. Системный подход позволяет глубже изучить объект анализа, получить более полное и целостное представление о нем, выявить причинно-следственные связи между отдельными частями этого объекта.